Кілт сөздер
Rosa alberta
Rosa spinosissima
CTAB негізіндегі әдіс
ДНҚ
Дәйексөзді қалай келтіруге болады
Аңдатпа
Rosa тұқымдасына экологиялық және табиғатты қорғауда маңызды бірнеше түрлер кіреді. Дегенмен, итмұрын жапырағының сығындыларынан жоғары сапалы геномдық ДНҚ алу екінші реттік метаболиттердің болуына байланысты қиын болуы мүмкін, бұл ДНҚ экстракциясына және кейінгі молекулалық талдауға кедергі келтіруі мүмкін. Бұл зерттеуде Қазақстанның Алтай және Тарбағатай аймақтарында жиналған Rosa acicularis Lindl., Rosa alberta Regel және Rosa spinosissima L. жапырақтары үшін CTAB (цетилтриметиламмоний бромиді) көмегімен ДНҚ экстракция протоколының тиімділігі мен әмбебаптығы бағаланды. Зерттеу барысында геномдық ДНҚ CTAB көмегімен бөлініп алынды және нәтижелер стандартты экстракция әдісімен алынған нәтижелермен салыстырылды. ДНҚ концентрациясы спектрофотометриялық түрде өлшенді. Экстракция әдістері арасындағы айырмашылықтар Уэлчтің t-тестін пайдаланып талданды.
CTAB протоколы талданған үлгілерде ДНҚ-ның статистикалық тұрғыдан айтарлықтай жоғары мөлшерін берді. ДНҚ-ның орташа концентрациясы түрге және жинау орнына байланысты 188,95-тен 385,24 нг/мкл-ге дейін болды. Ең жоғары орташа концентрация Алтай аймағынан алынған R. acicularis-те байқалды (385,24 ± 142,22 нг/мкл), ал ең төменгісі R. spinosissima-да байқалды (188,95 ± 89,38 нг/мкл). Жеке үлгілер арасында, әсіресе Тарбағатайдан алынған R. alberta мен Алтайдан алынған R. spinosissima арасында айтарлықтай айырмашылықтар анықталды. Стандартты әдісті қолданып анализденген үлгілер, әдетте, төмен және тұрақсыз ДНҚ концентрациясын көрсетті, экстракция әдістері арасындағы айырмашылық статистикалық тұрғыдан маңызды болды (p < 0,05).
CTAB негізіндегі протокол зерттелген Rosa түрлерін молекулалық талдау үшін жеткілікті ДНҚ өнімділігін берді және Қазақстанның әртүрлі аймақтарынан алынған өсімдік материалымен жұмыс істеуге жарамды болып шықты. Дегенмен, үлгілер арасындағы айтарлықтай өзгергіштік ДНҚ концентрациясының өзі оның сапасын толық көрсетпейтінін көрсетеді. Молекулалық биология зерттеулерінде одан әрі пайдалану үшін ДНҚ тазалығын және ПТР күшейту тиімділігін қосымша тексеру ұсынылады.